日本电影在线看正片第3集剧情介绍
少年侦探团因成功抓捕强盗而大出风头，某日，大家一起外出的时候，步美被一辆急驶而过的红色轿车撞伤，柯南用滑板载着光彦和元太一起去追肇事车辆，奇怪的是，每到转角车子都会停下来，好像故意等他们一样，当柯南等人追到石仓工厂时，车子不见踪影，之后，车子有突然出现并一路驶向警察局，没过得多久，柯南等人得知石仓工厂发生了命案……
柯南等人来到一所盖有五重塔的乡间寺庙，因为这里要开发观光而导致寺方和观光公司产生了争执，次日，观光公司的社长小田英明被人发现尸体吊在五重塔的尖端，就好像五重塔的传说一样，凡是破坏寺庙戒律，都会尝到恶果。在对尸体及其周围调查后，柯南找到了真正的案发现场。
光彦说他看到友里百合子在厕所前拼命擦眼泪，这虽然让大家大吃一惊，但是百合子说自己只是去厕所调整隐形眼镜而已，这说法合情合理，可柯南总觉得还有疑点，之后灰原一句无意的话语让柯南终于明白了事情的真相，于是，他急忙的跑去作案现场找到了证据，正巧阿笠博士也赶来接他们，柯南就借阿笠博士之口并重演凶手在放映室的杀人手法，将凶手绳之以法。
某天，小五郎收到一封请求信，一个叫中村操的人说他搬进继承的别墅之后，就碰到很多诡异的事情，到达后，柯南发现这个别墅确实充满谜团，大门扶手缺少的雕像，别墅里随处可见动物时钟，所有数字型时钟相同的刮痕，在屋顶的阁楼里好像有人，跟十年前疾风窃盗集团有关的新闻资料，高尔球袋上的DEMON字样，另外，还有从鸽子时钟里出来的恐怖妖怪，解开这些谜团的钥匙在哪里呢？
柯南注意到恐怖妖怪的头上分别有「R」「L」「N」三个字母，并将数字时钟上被划痕分开的11：0结合起来，解开了屋内的谜题，在他的提醒下，小五郎也逐渐的明白了这些暗号的含义，到了夜晚，大家按照屋主留下的暗号，再次回到了鸽子时钟下面，让他们惊讶的是这次从时钟里出现的不是妖怪而是……